Kérdés:
Melyek a DEseq2 számlálási egységei?
julianstanley
2018-01-27 03:53:09 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Gondolom, ez egy nagyon buta / egyszerű kérdés.

Milyen egységeket számít a DESeq2? Vagy az egységek önkényes, de belsőleg konzisztens becslései a tényleges olvasmányoknak?

Egy válasz:
Devon Ryan
2018-01-27 04:00:05 UTC
view on stackexchange narkive permalink

A számlálások "olvashatók" az egy végű adatkészleteknél és a "töredékek" a párosított végű adatkészleteknél. Más szavakkal, ezek az, amit a featureCounts és a htseq-count produkál. Azok a "normalizált számok", amelyekhez hozzáférhet a DESeq2-ben, a megfelelő megnevezés szerint egyszerűen normalizált verziók, amelyek az értékek a mintákban összehasonlíthatók.



ⓘ
Ezt a kérdést és választ automatikusan lefordították angol nyelvről.Az eredeti tartalom elérhető a stackexchange oldalon, amelyet köszönünk az cc by-sa 3.0 licencért, amely alatt terjesztik.
Loading...