Új vagyok az adattudományban. Van egy egysejtes gén expressziós adatkészletem több sejttípusból a C-ben. Elegans t. Az adatkészlet a A többsejtű organizmus átfogó, egysejtes transzkripciós profilja című lapból származik.
A fő kérdésem az, hogy Milyen megközelítéseket kell alkalmaznom a rossz sejtek kiszűrésére ebben eset, amikor több sejttípus van az adatkészletben?
Az oktatóanyag azonban kifejezetten azt mondja, hogy a mitokondriális gének alapján történő kiszűrési módszer valószínűleg nem fog működni, ha az adatkészletnek több sejttípusa van:
Az összes elemzése a sejttípusok együtt szükségtelenül felfújnák a MAD-t, és a legjobb esetben veszélyeztetnék az alacsony minőségű sejtek eltávolítását; vagy a legrosszabb esetben egy sejttípus teljes elvesztéséhez vezethet.
Minden javaslatot nagyra értékelnénk.