Ha a génexpresszió méretarányos és központosított, akkor csökkenti a gének közötti különbséget.

Képzelje el, hogy Önnek van egy A génje, amely általában magasan expresszálódik, és a standard eltérése 500 egység, a B génhez képest, amely nem sok expresszióval rendelkezik, és csak 5-ös szórása van.

A skálázott és a központosított gének egyaránt hozzájárulnak, mivel A általában 10000, B pedig általában 100 egységet fejez ki. Tehát mindkét esetben a szórás az expressziójuk 5% -a. Azt jelenti, hogy az egyik változata ugyanolyan fontos, mint a másikban.

Ha nem méretezik (és nem központosítják), akkor az első A gén jobban hozzájárul a variációhoz, mint a B gén, mert az abszolút számokban az expresszió variációja nagyobb.

Mindkettőt publikációkban használják, de úgy gondolom, hogy inkább a méretarányos és a középre helyezett, mert az első dimenzió "jobban" tükrözi a minták közötti különbségeket. Természetesen mindkettőt megteheti, és kiválaszthatja azt, amelyik jobban megmutatja, mit szeretne.